Selain musisi Jepang seperti Uyama Hiroto, Shing02 dan Minmi, Nujabes juga kerap kali berkolaborasi dengan musisi hip-hop underground dari Amerika seperti CYNE, Cise Starr (sebagai penampilan solo selain dari album collection hip-hop dari CYNE), Apani B, Five Deez, Substantial, CL Smooth, Terry Callier, dan juga rapper dari Brtish Funky DL. Nujabes juga menjadi anggota dari rumah produksi duo Urbanforest, sebuah kolaborasi eksperimental dengan Nao T.
Nujabes adalah salah satu kontributor paling produktif dalam menangani latar belakang musik atau background musik dan dan juga soundtrack dalam Samurai Champloo, sebuah anime yang memadukan pengaturan dalam fudal Jepang dengan anakronisme modern, terutama dalam kaitannya dengan budaya hip-hop.
Hal lain yang membedakan suara Nujabes adalah penggabungan yang dilakukan Jun Seba dengan sampel Jazz dalam lagu nya. Nujabes terutama memasukkan sampel jazz pada lagunya yang berjudul "The View Final" dari album Metaphorical Music. Music jazz yang juga ada "Love Theme From Spartacus" yang dibawakan oleh Pianis Bill Evans, seperti yang juga dimainkan oleh Saxophonist bernama Yusef Lateef, merupakan sample musik Jazz yang digunakan oleh Nujabes di lagu yang berjudul "The View Final." Nujabes menggabungkan melodi soprano awal dari permainan Lateef, memotong penampilan solonya, dan menyatukan potongan music piano ke dalam lembaran music Nujabes.
Pada tanggal 26 Februari 2010, Jun Seba mendapat kecelakaan lalu lintas saat keluar dari Shuto Expressway, larut malam. Ia meninggal di sebuah rumah sakit di Shibuya Ward setelah semua upaya yang ada gagal dilakukan untuk menghidupkan kembali Jun Seba. Usianya 36 tahun. Dan yang dilakukan adalah penguburan pribadi yang hanya dihadiri keluarga besar dari Jun Seba. Hydeout Productions telah menyatakan bahwa Nujabes meninggalkan track-track uang belum dipublikasikan, dan mereka berencana untuk merilis dalam waktu dekat ini.